聊城市农业科学院始建于1959年，是聊城市唯一一家公益型综合性农业科研机构，为市政府直属公益一类事业单位。办院宗旨是组织开展现代农业研究及技术应用示范推广，为农业农村农民服务。

全院在职职工132人，其中，正高级职称15人、副高级职称26人、中级职称37人。全院有博士及硕士研究生59人，占全体职工的45%。建院60多年来，围绕全市农业生产需要，开展了300余项重大科学研究，取得主要科研成果230余项，有163项获市级及以上科技奖，为我市农业农村发展作出了重要贡献。拥有享受国务院特殊津贴专家4人，省级有突出贡献的中青年专家1人，市级有突出贡献的中青年专家2人，省、市级劳模4人，富民兴鲁劳动奖章1人，富民兴聊劳动奖章1人，聊城最高科技奖1人，聊城市科技创新之星1人。

2017年10月，聊城市农科院实施法人治理结构改革，并以此为契机，紧紧围绕聊城农业产业发展需要，不断调整办院方向，大刀阔斧改革内部机构设置，创新科研项目管理和科研成果转化机制，实施“接天立地”工程，狠抓人才培养和评价考核，广大职工干事创业的活力日益激发，服务聊城农业产业发展的能力进一步提升。

目前，聊城市农科院已初步形成“科研与合作部—技术创新中心—创新团队—课题组”的科研架构和食药用菌（种质）、现代育种、蔬菜、果品、油料、动物科学、智慧农业及装备、功能性农产品（加工）等8个重点建设学科。现拥有国家现代农业产业技术体系玉米、棉花、小麦产业3个综合试验站，山东省现代农业产业技术体系蔬菜、花生、小麦、玉米、棉花、果树6个综合试验站，1个国家级技术研究中心分中心（中国果蔬贮藏加工技术研究中心聊城分中心），食用菌种质创新、玉米种质创新、分子育种技术研究、果蔬采后贮藏加工4个市级重点实验室，5个高端科技人才工作站，1个市级“人才飞地”工作站，共计20个科技平台。

近年来，聊城市农科院培育的棉花新品种“聊棉15号”通过了国家审定，“聊棉21号”“聊玉1310”“聊棉6号”“聊棉19号”通过了山东省审定，16个作物新品系进入国家、省品种审定试验；主持起草的16项技术规程获省农业厅批准，1项省级地方标准、13项市级地方标准获批发布，对30余项最新科技成果进行了示范和推广；“设施蔬菜化肥农药减施推广服务项目”荣获2021年全国文化科技卫生“三下乡”活动示范项目，食用菌种质技术创新中心荣获山东省首届科技兴农奖，为聊城现代高效农业的快速发展提供了有力的科技支撑。